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要建设适合自己的无菌室，首先需要确定一般实验内容，及实验室过程中可能出现的结果。
不同的实验有不同的实验要求。
根据空气洁净度的不同，无菌室可分为百级，千级，万级，十万级，百万级等等。
净化等级一般分为100级、1000级、10000级、100000级，现在2010年版的gmp 净化车间已经不用这个叫法了，分为abcd级别，分别相对应于98版的几个级别，通过检测区域内的尘埃粒子数、浮游菌数、沉降均数评价净化级别，各个级别有不同的要求，净化等级分静态、动态两种。100级无菌室可用于医药工业的无菌制造工艺等，这一洁净室大量应用于，植如体内物品的制造，外科手术，包括移植手术，那些对xi菌感染特别敏感的病人的隔离治，比如像骨髓移植病人术后的隔离治。
根据需要的工作人员及仪器设备，来确定无菌室的面积。
一般无菌室面积在5-7平方，高度不超过2.4m，四周围护结构，墙面和地面应光滑，墙壁与地面、天花板连接处应呈凹弧形无缝隙，无死角，易于清洁和消毒。
无菌室入口处应设置缓冲间，缓冲间内应安装非手动式开关的洗手盆，并可有毛巾。缓冲间应有足够的面积以保证操作人员更换工作服及鞋帽。
无菌室内工作台的高度约2000px，工作台应保持水平，工作台面应无渗漏耐腐蚀易于清洁、消毒。
无菌室内光照应分布均匀，工作台面的光照度应不低于540lx。
无菌室应具备适当的通风和温度调节的条件。无菌室的推荐温度为20，相对湿度为40-60%。
缓冲间及操作室内均应设置能达到空气消毒效果的紫外灯或其他适宜的消毒装置。
一般无菌室中，需要用到纯水或蒸馏水，以满足相关实验的要求。无菌间内不应安装下水道。
无菌操作室应具有空气除菌过滤的单向流空气装置，操作区洁净度100级或放置同等级别的超净工作台，室内温度控制18~26℃，相对湿度45%~65%。缓冲间及操作室内均应设置能达到空气消毒效果的紫外灯或其他适宜的消毒装置，空气洁净级别不同的相邻房间之间的静压差应大于5pa，洁净室（区）与室外大气的静压差大于10pa。无菌室内的照明灯应嵌装在天花板内，室内光照应分布均匀，光照度不低于300lx。缓冲间和操作间所设置的紫外线杀菌灯（2~2.5w/平方米），应定期检查辐射强度，要求在操作面上达40/μw/平方厘米，不符合要求的紫外杀菌灯应及时更换。
无菌室跟生物实验室有一定的区别，生物实验室更注重于生物的研究和观察，所以有的实验室对实验室洁净度是没有要求的。
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